Местное празднование Костромской митрополии – воспоминание обретения святых мощей преподобного Пахомия Нерехтского – совершается 19 мая (по новому стилю).
В 1675–1676 годах в Свято-Троицкой Пахомиево-Нерехтской обители на месте деревянного храма, в котором был погребен основатель монастыря, возвели каменный. При устройстве фундаментов под алтарем прежнего храма 6 мая (по старому стилю) 1675 года были обретены святые мощи преподобного Пахомия, которые оставили под спудом в устроенном при новом храме Пахомиевом приделе. С того времени по благословению патриарха Иоакима началось всероссийское почитание святого.
После возрождения Пахомиево-Нерехтского монастыря в ХХ веке святые мощи основателя обители продолжали оставаться под спудом, но в сентябре 2010 года во время реставрационных работ по укреплению стен и фундамента Пахомиева придела состоялось их повторное обретение. Мощи были исследованы специальной комиссией, и 19 марта 2011 года на всенощном бдении их торжественно перенесли и положили в новую раку.
28 мая 2024 года. Епископ Галичский и Макарьевский Алексий у святых мощей преподобного Пахомия Нерехтского.